水草叶片是进行光合作用的主要场所,通过叶片吸收营养的方式称为根外营养。水草的叶片是由表皮组织和叶肉组织及疏导组织所组成的,而叶片上的表皮细胞,气孔就是表皮细胞分化出来的组织,并按一定的距离分布于叶表面上。气孔的数目依作物不同而异,高者如水生类植物每平方毫米可达2000个,而一般陆生植物只有50-300个。它的主要功能是与外界进行气体交换及蒸腾水分。气孔具有开闭运动的特性,通过气孔运动与大气或水体进行物质交换。
水草叶片是吸收矿质养分的主要部位,大部分水草靠叶片吸收水中硝酸盐,以及有机物质来满足成长需要。水草只有在光照之下才能行光合作用,吸收二氧化碳和水中的氢化物。水草除了叶片吸收营养之外根部也同样可以吸收营养物质。大多数水草都有发达的根系,根系是水草从周围环境获取矿物质物质的重要器官,根系发育是否良好也直接影响水草生存的质量。